本发明属于监测系统技术领域,公开了一种空地一体化红树林监测系统及控制方法,通过无人机或者其他航拍手段获取统计目标区域的高分辨率航空影像,分析红树林的结构分布;通过采集水文、气象环境因子对所在地域进行气象水文的检测;根据步骤一检测的数据,用高分影像树冠提取软件打开图像进行处理,与原有图像进行对比,确定红树林数量;根据步骤一检测的数据,结合影像光谱与纹理特征,对红树林虫害状况进行估测;利用统计学系统抽样原理,对单块区域的红树林对野生动物进行种类统计,根据检测动物种类数量,对整体的红树林内的动作种类进行评估,得出动物种类。本发明采用遥感信息技术进行红树林的监测及信息的传输,提高了监测的质量和效率。