本发明提供了一种提高植物低温耐受性的CRR2基因,其核苷酸序列如SEQID NO:1所示。本发明还提供了该CRR2基因对应转录的RNA及其应用。本发明的CRR2基因及其对应转录的RNA可特异地响应低温胁迫反应。通过亚细胞定位分析表明其在细胞核、细胞质中均有定位。进一步将CRR2基因转到木薯中,获得木薯CRR2高表达株系,发现CRR2高表达株系对低温胁迫更加耐受,存活率也大幅提高,同时,CRR2高表达株系中脯氨酸含量显著提高,低温处理后丙二醛(MDA)的含量显著降低,表明CRR2和CRR2基因可以提高植物的低温耐受性,将来利用其对植物进行遗传改良,可为提高植物低温耐受性提供有效的资源。