本发明提供了一株单列毛壳菌、包括单列毛壳菌的菌剂及其制备方法和应用,属于微生物菌剂技术领域;所述单列毛壳菌的保藏编号为:CGMCC No.18156。本发明的单列毛壳菌通过促进秸秆有效降解、增加土壤中有机碳和可溶性碳氮含量、抵抗病原菌来促进土壤肥力提升。本发明的单列毛壳菌能够在土壤中自行生长繁殖,与土著微生物群落达到生态稳定平衡,无需重复添加。本发明的单列毛壳菌来源于长期进行秸秆还田的农田土壤,可以实现绿色生态农业,以确保食品的优质性与安全性。本发明的单列毛壳菌的扩大培养过程操作简单,成本低廉,能够制备成微生物菌剂,在农业领域推广应用。