本发明公开了一种高致病性禽流感病毒血凝素蛋白识别方法，能够用于高致病性禽流感病毒血凝素蛋白识别，可为理解高致病性禽流感病毒血凝素蛋白的结构特征提供参考，通过对血凝素蛋白的识别，从而可以间接地判别其所属的禽流感病毒株的致病性高低，包括如下步骤：a)基于主成分分析方法，建立氨基酸全息拓扑结构得分矢量；b)应用氨基酸全息拓扑结构得分矢量对流感病毒血凝素蛋白的结构进行表征；c)用自交叉协方差方法对每个流感病毒血凝素蛋白的表征变量做归一化处理；d)用径向基核支持向量机建立禽流感病毒血凝素蛋白识别模型；e)用径向基核支持向量机建立高致病性禽流感病毒血凝素蛋白识别模型。
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