本发明涉及一种能够促进番茄生长并拈抗三种病害的内生细菌及其分离方法,内生细菌Fb9(Bacillum?sp.),保藏日期为2011年12月8日,保藏于中国典型培养物保藏中心,保藏编号为:CCTCC?NO:M?2011448。本发明通过平板对峙试验筛选出对三种病菌抑菌效果最好的Fb9菌株,对番茄早疫病菌、番茄菌核病菌、黄瓜枯萎病菌抑菌率分别为70.81%、74.35%、65.17%。Fb9菌株对番茄的生长具有促进作用,对番茄早疫病的室内盆栽防治效果为63.7%。经试验:通过分离筛选获得对番茄早疫病具有防治效果的番茄内生细菌菌株,并鉴定出该菌株对番茄的生长具有促进作用。