本发明涉及水性聚氨酯胶粘剂,特指一种用在木材加工上的水性聚氨酯胶粘剂的制备方法。其分为三个阶段,第一阶段为逐步聚合,即由低聚物多元醇、亲水单体、异氰酸酯、改性单体通过逐步聚合和自由基聚合,生成改性聚氨酯预聚体;第二阶段为中和成盐后改性聚氨酯预聚体在水中的分散;第三阶段为加入扩链剂后形成水性聚氨酯乳液,所述改性聚氨酯预聚体中R值为1.02~2.0,R值指体系中总NCO的摩尔数比体系中总OH的摩尔数,合成条件为:真空度为0.090~0.1MPa,聚合温度65~90℃,聚合反应时间2~4小时,中和温度:40~60℃,固含量为20~50%。本发明采用适量的改性单体与聚氨酯接枝或交联可明显提高产品的耐水、耐溶剂和粘接强度,使产品性能更优。