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一种非编码基因的高通量鉴定方法

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本发明公开了一种非编码基因的高通量鉴定方法,包括以下步骤:(1)提取样品总DNA,进行DNA测序,并将测序结果拼接成contig序列;(2)提取样品总RNA,从中分离长度为18~30nt的小RNA,对小RNA进行测序;(3)将小RNA测序的Reads匹配到DNA的contig序列上进行两端延伸,获得候选前体序列;(4)利用计算机软件对候选前体序列进行高通量鉴定。该发明主要针对于没有基因组图谱物种的microRNA及其基因的系统鉴定,发现新的非编码RNA基因;对已有完成基因组测序的生物同样适用;且不局限于microRNA,同样适用于具有前体结构的小RNA的检测。

CN201210170788

CN102747147B

发明专利

2012-05-29

2014-06-18

C12Q1/68(2006.01)I

中山大学

周惠、温俊志、屈良鹄、郑凌伶、廖建友、杨建华

510275 广东省广州市新港西路135号

中国(CN)