一种香菇菌杆切除装置,涉及菇类菌杆。设有机架、空料架间歇提升系统、栅格型料架、料架上升下降系统、往复拉推料架系统、香菇菌杆同步夹紧系统、成品间歇回收提升系统、香菇菌杆切割和菇头回收装置和控制系统;所述机架设有料架提升段机架、香菇整排段机架与香菇菌杆切割段机架;空料架间歇提升系统设有空料架底座和空料架支架;所述料架上升下降系统设有水槽及循环水系统、凸轮传动及复位装置、上下运动导轨槽和挡菇板;可通过PLC控制系统和机械传动系统实现对香菇菌杆部的自动切割控制。并且可以多进程同步进行工作,自动化程度高,能有效提高产品质量和生产效率,有效减少对劳动力的使用,节约成本,具有广阔的市场前景。