本发明公开了一种增加大豆氮磷吸收和产量的人工合成益生菌群及其应用。该人工合成益生菌群FN?SynCom1分离自大豆根系,包含3株培养且有显著促生功能的细菌,其中菌株RBC?258具有IAA分泌能力,菌株RBC?288和RBC?289具有溶解难溶性有机磷和无机磷能力。本发明提供的大豆人工合成益生菌群FN?SynCom1在室内和田间接种条件下能明显促进大豆对氮、磷的吸收,促进大豆生长,增加生物量。其中在田间条件下与不接种的大豆相比接种该益生重组菌群FN?SynCom1能提高氮(37.2%?69.6%)、磷(57.5%?67.7%),且增加大豆的产量23.3%?36.1%。