本发明提供一种观察植物内部显微结构的染色方法,包括:(1)徒手切片;(2)将徒手切片放入甘油中保存待用;(3)徒手切片置于载玻片上,滴加甲苯胺蓝将徒手切片染色后,滴加清水,在显微镜下观察通气组织;(4)滴加间苯三酚染色后,然后滴加浓盐酸染色,在显微镜下观察木质化;(5)滴加75%乙醇清洗后,滴加苏丹7B染色,再滴加清水,在显微镜下观察栓质化;(6)滴加硫氢酸黄连素溶液染色后,滴加清水,滴加苯胺兰溶液,再滴加清水,在荧光显微镜下观察凯氏带。该方法可将徒手切片保存在甘油中,随取随用,使实验时间更加灵活,且只需1个完好的切片可先后进行4次染色观察,减少徒手切片的工作量,节省实验材料,提高了实验效率。