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基于RNA-seq分析人肝癌耐药细胞BEL-7402/FU的差异表达基因

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目的 分析调控人肝癌耐药细胞BEL-7402/FU耐药的关键基因和信号通路,进而探讨引起肝癌多药耐药的可能机制,寻找逆转肝癌多药耐药的潜在靶点.方法 TRIzol法提取人肝癌细胞BEL-7402与耐药细胞BEL-7402/FU的总RNA,采用RNA-seq测序技术检测两组细胞的数字基因表达谱并筛选差异表达基因(DEGs),运用生物信息学分析方法对DEGs进行生物通路等富集分析.结果 检测到上调的DEGs数为2 899个,下调的DEGs数为3 313个;GO富集及KEGG分析发现涉及的主要生物进程为单生物体过程类别、细胞类别、结合分子功能类别,主要的信号通路为代谢通路等;PPI分析显示,在蛋白互作网络中具有重要作用的基因为TP53、EGFR、MAPK8、BCL2L1、STAT5A、STAT5B、ABALON、FYN、CDKN1A、BCL2等.结论 肝癌耐药过程涉及到多个基因和通路,这些具有差异的基因和通路或将成为逆转肝癌耐药的靶点.
Analysis of differentially expressed genes of chemo-resistant BEL-7402/FU cells in human hepatocellular carcinoma

周谢海、张婷、谢刚、崔志华、许杜娟、夏泉

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安徽医科大学药学院,合肥230032

安徽医科大学第一附属医院药剂科,合肥230022

国家中医药管理局三级药物化学实验室,合肥230001

肝癌耐药 RNA-seq技术 差异表达基因

安徽省科技攻关计划项目

1401045014

2019

安徽医科大学学报
安徽医科大学

安徽医科大学学报

CSTPCD北大核心
影响因子:1.095
ISSN:1000-1492
年,卷(期):2019.54(3)
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