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LncRNA XR_378418对肝星状细胞生物学行为及转录组学影响

Effect of LncRNA XR_378418 on the biological behavior and transcriptome of hepatic stellate cells

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目的 探究长链非编码RNA(LncRNA)XR_378418在肝星状细胞JS-1生物学行为中的作用,并基于转录组测序探索LncRNA XR_378418参与肝纤维化发生的潜在分子机制.方法 构建重组质粒pcDNA-LncRNA XR_378418和pcDNA-NC,分别转染JS-1细胞;通过实时荧光定量PCR(RT-qPCR)、细胞计数试剂盒8(CCK-8)以及划痕实验分别检测LncRNA XR_378418的表达水平、JS-1细胞增殖和迁移情况;通过高通量测序分析LncRNA XR_378418对JS-1细胞转录组学的影响.结果 RT-qPCR结果显示,过表达组中的LncRNA XR_378418表达水平高于对照组(P<0.05);CCK-8和划痕结果显示,LncRNA XR_378418表达增加后,JS-1细胞增殖和迁移能力增强;高通量测序结果显示,共挑选出248个差异基因,其中上调的基因有127个、下调的基因有117个;基因本体论(GO)功能富集分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)功能富集分析结果显示,LncRNA XR_378418过表达改变了JS-1细胞部分基因的转录能力,参与调控细胞黏附、细胞自噬、Ca2+信号传导等功能.结论 Ln-cRNA XR_378418可促进JS-1细胞增殖和迁移,影响JS-1细胞中细胞黏附、钙离子信号转导等相关基因的表达.

long non-coding RNAliver fibrosishepatic stellate cellshigh-throughput sequencing

张雪、陈森、汪小莉、周秋梅

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安徽中医药大学药学院,合肥 230012

安徽中医药大学第一附属医院临床研究实验中心,合肥230031

长链非编码RNA 肝纤维化 肝星状细胞 高通量测序

国家自然科学基金

82004139

2024

10.19405/j.cnki.issn1000-1492.2024.01.020

安徽医科大学学报
安徽医科大学

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CSTPCD北大核心
影响因子：1.095
ISSN：1000-1492
年,卷(期)：2024.59(1)
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