蚌埠医学院学报2024，Vol.49Issue(1) ：1-6.DOI:10.13898/j.cnki.issn.1000-2200.2024.01.001

APP/PS1转基因小鼠脑组织环状RNA的差异表达谱及相关ceRNA构建

Differential expression profile of circular RNA in brain tissue of APP/PS1 transgenic mice and its related ceRNA construction

马琳秋 侯明亮 李金平 杨红岩 廖旗荣 李小雄 洪文娟 周华东
蚌埠医学院学报2024，Vol.49Issue(1) ：1-6.DOI:10.13898/j.cnki.issn.1000-2200.2024.01.001
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APP/PS1转基因小鼠脑组织环状RNA的差异表达谱及相关ceRNA构建

Differential expression profile of circular RNA in brain tissue of APP/PS1 transgenic mice and its related ceRNA construction

马琳秋 1侯明亮 1李金平 1杨红岩 1廖旗荣 1李小雄 1洪文娟 1周华东2
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作者信息

  • 1. 蚌埠医科大学第一附属医院 神经内科,安徽 蚌埠233004
  • 2. 蚌埠医科大学第一附属医院 神经内科,安徽 蚌埠233004;陆军特色医学中心 神经内科,重庆400020
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摘要

目的:探讨阿尔茨海默病(AD)模型小鼠脑组织中环状RNA(circRNA)的差异表达谱,构建circRNA-miRNA-mRNA调控网络,明确circRNA在AD发生中的调控机制.方法:采用基因芯片技术检测APP/PS1转基因AD模型小鼠大脑中circRNA的差异表达,对差异circRNA进行基因本体论(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路分析,采用实时定量聚合酶链反应验证随机选取的5个差异表达的circRNA,构建circRNA-miRNA-mRNA,进行AD靶基因功能预测分析.结果:共筛选出52个差异表达的circRNA,其中28个上调,24个下调.GO和KEGG的富集分析结果显示,差异表达的circRNA的亲本基因主要参与神经系统发育、蛋白质结合、RNA运输、调控干细胞多能性的信号通路和Hippo信号通路.生物学信息分析成功构建circRNA-miRNA-mRNA的竞争性内源(ceRNA)网络,显示这些靶基因富集的功能可能通过小分子结合、浆膜、cAMP信号通路和Rap1信号通路发挥作用.结论:AD模型小鼠大脑中存在多种差异表达的circRNA,这些差异基因可能通过circRNA-miRNA-mRNA调节网络参与AD发生的分子调控.

关键词

阿尔茨海默病/环状RNA/微小RNA/circRNA-miRNA-mRNA调节网络

Key words

Alzheimer's disease/circular RNA/microRNA/circRNA-miRNA-mRNA regulatory network

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基金项目

国家自然科学基金(81771177)

出版年

2024
蚌埠医学院学报
蚌埠医学院

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CSTPCD
影响因子：0.917
ISSN：1000-2200
参考文献量21
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