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东北虎豹国家公园植物DNA微条形码数据库

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DNA宏条形码技术已成为环境DNA分析的常用手段,选择合适的引物并建立本地微条形码数据库,对于环境DNA结果的进一步探究十分重要.本文通过数字模拟PCR技术,对食草动物环境DNA研究中常用的3个微条形码进行比较,发现psbCL具有最高或略低于最高的覆盖度和分辨率,在环境DNA分析中推荐优先使用.利用psbCL建立了东北虎豹国家公园本地微条形码库,同时利用psbCL扩增梅花鹿粪便中的进食物种,以比较本地微条形码库和公共数据库在物种鉴别能力方面的差异.结果表明,本地数据库在属和种水平均提高了鉴别能力.因此,本研究推荐环境DNA分析中建立本地微条形码库,以提高研究的精度,本研究所建立的东北虎豹国家公园植物DNA微条形码数据库也将为未来高精度的环境DNA分析提供基础.
A DNA mini-barcode reference library for environmental DNA study in the Northeast Tiger and Leopard National Park

plant DNA mini-barcodeenvironmental DNADNA metabarcodingbarcode librariespsbCL

吴峰、温佩颖、唐志珍、李青鉴、朱頔、王天明、葛剑平、王红芳

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生物多样性与生态工程教育部重点实验室,东北虎豹国家公园保护生态学国家林草局重点实验室,北京师范大学生命科学学院,100875,北京

植物DNA微条形码 环境DNA DNA宏条形码 条形码数据库 psbCL

国家自然科学基金资助项目

32071494

2023

10.12202/j.0476-0301.2023123

北京师范大学学报(自然科学版)
北京师范大学

北京师范大学学报(自然科学版)

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子：0.505
ISSN：0476-0301
年,卷(期)：2023.59(4)
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