包头医学院学报2023，Vol.39Issue(9) ：34-39.DOI:10.16833/j.cnki.jbmc.2023.09.007

基于转录组测序对反流性食管炎相关长链非编码RNA HOTAIR的初步筛选及鉴定

Preliminary screening and identification of long-chain non-coding RNA HOTAIR related to reflux esophagitis based on transcriptome sequencing

牛璐 孟宪梅 邵国
包头医学院学报2023，Vol.39Issue(9) ：34-39.DOI:10.16833/j.cnki.jbmc.2023.09.007
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基于转录组测序对反流性食管炎相关长链非编码RNA HOTAIR的初步筛选及鉴定

Preliminary screening and identification of long-chain non-coding RNA HOTAIR related to reflux esophagitis based on transcriptome sequencing

牛璐 1孟宪梅 2邵国1
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作者信息

  • 1. 包头医学院,内蒙古 包头 014040
  • 2. 包头医学院第二附属医院消化内科
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摘要

目的:阐明反流性食管炎中差异表达的基因并探讨其造成反流性食管炎黏膜损伤的可能机制,初步筛选并鉴定长链非编码RNA HOTAIR在反流性食管炎中的表达变化和作用.方法:取内镜下反流性食管炎黏膜糜烂处组织标本及糜烂旁黏膜光滑食管组织进行转录组测序和生物信息学分析,实时荧光定量PCR测定两类组织中长链非编码RNA HOTAIR的表达变化,并分析其与反流性食管炎患者年龄的关系.结果:转录组测序结果显示反流性食管炎糜烂组和糜烂旁组之间有多种基因差异表达,其中 7 661 个基因表达下调.生物信息学分析显示差异表达的基因富集于免疫反应.对于筛选出的长链非编码RNA HOTAIR,实时荧光定量PCR显示其相对表达量与反流性食管炎患者年龄相关(P＜0.05).相较于糜烂旁组,大年龄组中反流性食管炎糜烂组的HOTAIR表达上调(P＜0.05),而在小年龄组中反流性食管炎糜烂组HOTAIR表达下调(P＜0.05).结论:反流性食管炎多种差异表达的基因可能通过免疫反应参与该病的发生发展过程.筛选出的长链非编码RNA HOTAIR表达变化在不同年龄患者中呈现相反的趋势,提示HOTAIR可能在反流性食管炎中发挥重要作用并可作为诊断的重要辅助指标.

关键词

反流性食管炎/黏膜损伤/转录组测序/长链非编码RNA/HOTAIR

Key words

Reflux esophagitis/Mucosal injury/Transcriptome sequencing/Long-chain non-coding RNA/HOTAIR

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基金项目

内蒙古自然科学基金(2018MS08050)

内蒙古自治区科技计划项目(201803020)

出版年

2023
包头医学院学报
内蒙古科技大学包头医学院

包头医学院学报

影响因子：0.543
ISSN：1006-740X
参考文献量1
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