纳税筹划是单位在国家税务法律法规允许的前提下,通过科学安排、流程再造等方式,减轻单位税务负担,从而加强单位现金流量,促进单位财务管理价值最大化.在我国,科研院所是性质比较特殊的单位,既有事业单位的公益性质,也有企业的盈利特点,近些年,科研院所也开始意识到税务筹划对单位管理的重要性,开始重视筹划工作.本文通过聚焦科研院所在纳税筹划方面存在的问题,提出科研院所单位加强税务筹划的优化策略,包括提升税务人员筹划意识,优化财务业务流程,利用固定资产折旧提高税前抵扣金额,利用研发费用加计扣除提高税前抵扣金额,利用优惠税率及退税政策降低税负等六项措施,以期为科研院所纳税筹划提供有益参考.