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茶树SRO基因家族的鉴定及表达分析

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SROs(Similar to rcd one)是植物特有的基因家族.本研究利用生物信息学方法从茶树基因组中鉴定获得9个茶树SRO基因家族成员,分别命名为CsRCD1—4和CsSRO1—5.9个茶树SRO基因的编码蛋白均具有特征结构域PARP和RST,具有相似的保守基序.系统进化树分析聚分为3组,I组包含CsRCD1—4,Ⅱ组包含CsSRO1和CsSRO2,Ⅲ组包含CsSRO3—5.基因结构分析表明每个CsSRO基因含有4至9个外显子.8个茶树组织转录组数据分析表明,CsRCD1、CsRCD3和CsRCD4可能在茶树不同发育阶段具有重要作用;大多数CsSRO基因在根和成熟叶中较高表达.上游启动子区域分析发现大量与植物发育、激素及胁迫响应密切相关的顺式作用元件,进一步对CsSRO基因在干旱和脱落酸处理下的表达模式进行分析发现,9个CsSRO基因均被诱导表达,CsSRO基因可能与茶树抗旱密切相关.
Genome-wide Identification and Expression Analysis of SRO Gene Family in Camellia sinensis

郭永春、王鹏杰、陈笛、郑玉成、陈雪津、叶乃兴

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福建农林大学园艺学院/茶学福建省高校重点实验室,福建 福州 350002

茶树 SRO 系统进化 干旱胁迫

福建省"2011协同创新中心"中国乌龙茶产业协同创新中心专项福建省"2011协同创新中心"中国乌龙茶产业协同创新中心专项国家现代农业(茶叶)产业技术体系建设专项资金项目国家现代农业(茶叶)产业技术体系建设专项资金项目福建农林大学科技创新专项基金福建农林大学科技创新专项基金

闽教科〔2015〕75号CARS-19CXZX2016117CXZX2017181

2019

茶叶科学
中国茶叶学会

茶叶科学

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子:1.594
ISSN:1000-369X
年,卷(期):2019.39(4)
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