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茶网蝽线粒体基因组全序列测定及系统发育分析

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为明确茶网蝽(Stephanitis chinensis)线粒体基因组序列特征,探究其系统发育地位.利用Illumina和Sanger测序对陕西省安康市茶网蝽线粒体基因组进行测定.结果显示,茶网蝽线粒体基因组全长18085 bp,包含37个基因(13个蛋白质编码基因,22个tRNA,2个rRNA)和1个3678 bp的控制区,基因排列与昆虫线粒体祖先基因顺序(Ancestral gene order)相同.基因组AT含量为78.10％.13个蛋白质编码基因中,6个以ATG起始,7个以ATT或ATA起始,10个以TAA或TAG为终止密码子,cox2、atp6和cox3以T终止,蛋白质编码基因使用频率最高的密码子是UUA、AUU、UUU和AUA,使用频率最高的氨基酸为亮氨酸(Leu)、异亮氨酸(Ile)、苯丙氨酸(Phe)和丝氨酸(Ser).22个tRNA基因存在GU、UU、GA和AA错配23处,trnS1(GCU)缺少DHU臂,其他tRNA均能形成典型三叶草结构.控制区包含位于前端的3种非串联重复、4个(TTAG)n和1个位于后端的串联重复序列,含有多个茎环结构.系统发育分析结果表明,茶网蝽与直脊冠网蝽(Stephanitis mendica)的亲缘关系最近,所有网蝽科聚为一簇,位于发育树的根部.
The Complete Mitochondrial Genome Sequence and Phylogenetic Analysis of the Stephanitis chinensis

杨金宏、谢满超、文欣茹、陈蕊茹、孔卫青

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安康学院现代农业与生物科技学院/陕西省茶叶省市共建重点实验室,陕西 安康 725000

安康学院陕西省蚕桑重点实验室,陕西 安康 725000

茶网蝽 线粒体基因组 序列分析 系统发育

陕西省重点研发计划安康市科技发展计划安康学院科研项目

2018ZDXM-NY-057AK2021-NY-22017AYXNZX11

2022

茶叶科学
中国茶叶学会

茶叶科学

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子：1.594
ISSN：1000-369X
年,卷(期)：2022.42(6)
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