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基于全基因组重测序的白化茶树mSNP标记开发及验证

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为探究白化茶树遗传变异信息及mSNP液相芯片在茶树种质资源鉴定中的可行性,利用全基因组重测序对18份白化茶树资源进行遗传多样性分析和突变位点检测.结果表明,基于全基因组水平的SNP标记可将18份白化茶树资源分为3类,且基本呈现出具有亲缘关系或地理位置接近的资源聚在一起的趋势;对重测序数据进行功能注释后发现,在18份白化茶树资源中存在17056个共有非同义突变基因,其中14个叶绿素合成相关基因中存在98个错义突变位点.随后,基于前期获得的基因组变异信息开发了一套包含59个mSNP、222个SNP位点的液相芯片,利用该液相芯片检测13份茶树资源的基因型信息.结果表明,同一品种两两之间的遗传相似度在92％～98％,不同品种间的遗传相似度则在84％以下,表明该芯片可对18份白化茶树资源进行准确鉴别,研究结果可为mSNP液相芯片在茶树种质资源鉴定、分子标记辅助育种等方面的应用奠定基础.
Development and Application of Albinotea Plant mSNP Molecular Markers Based on Genome-wide Resequencing

刘浩然、张晨禹、龚洋、叶圆圆、陈杰丹、陈亮、刘丁丁、马春雷

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中国农业科学院茶叶研究所/农业农村部特种经济动植物生物学与遗传育种重点实验室,浙江 杭州 310008

中国农业科学院研究生院,北京 100081

茶树 mSNP分子标记 靶向测序基因型检测 遗传多样性 全基因组重测序

国家重点研发计划课题浙江省农业(茶树)新品种选育重大科技专项子课题中国农业科学院茶叶研究所基本科研业务费项目浙江省自然科学基金

2021YFD12002032021C02067-6-11610212022009LQ20C160010

2023

茶叶科学
中国茶叶学会

茶叶科学

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子：1.594
ISSN：1000-369X
年,卷(期)：2023.43(1)
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