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大豆GmANKTM家族非生物胁迫生物信息学分析

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ANKTM(Ankyrin repeats transmembrane)蛋白属锚蛋白超家族,包含ANK基序和跨膜结构域,在非生物胁迫、生物胁迫、诱发衰老中起重要作用.为了解大豆ANKTM(Ankyrin repeats transmembrane)家族成员及其胁迫响应规律,利用生物信息学和q-PCR方法研究大豆ANKTM家族成员.结果表明,从大豆中鉴定出62个ANKTM家族基因,分为5个亚家族.该家族编码蛋白含346～1039个氨基酸,分子质量为37.88～114.83 ku,等电点(pI)为4.46～9.61.分析蛋白结构域发现,GmANKTM家族含ANK基序和跨膜结构域,58个基因含PGG结构域,此外还含ACBP、SBP、DHHC、G-PCR等其他结构域.除ANK基序、跨膜结构域和PGG结构域外其他结构域主要集中在第5亚家族.其余亚家族结构域分布位置和数量相近.启动子区域顺式元件分析发现,GmANKTM家族基因含光响应元件、激素响应相关元件和逆境响应相关元件.组织分析发现GmANKTM家族第5亚家族组织表达量高于其他亚家族.利用大豆转录组数据库分析发现,GmANKTM家族基因受盐胁迫和干旱胁迫强烈诱导.
Bioinformatics analysis of GmANKTM family abiotic stress in soybean

柏锡、王昕奕、陈云、杨亚男、黄荣梅、郑佳佳、王佳

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东北农业大学生命科学学院,哈尔滨 150030

大豆 ANKTM家族 生物信息学 非生物胁迫

转基因生物新品种培育重大专项

2016ZX08004002

2019

10.19720/j.cnki.issn.1005-9369.2019.07.003

东北农业大学学报
东北农业大学

东北农业大学学报

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子：0.752
ISSN：1005-9369
年,卷(期)：2019.50(7)
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