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PEG模拟干旱胁迫下野生大豆转录组分析

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为研究耐旱型野生大豆在干旱胁迫下基因表达谱的变化,从备选野生大豆材料中筛选抗旱性强的野生大豆品种,同时探讨最适PEG胁迫浓度,而后以野生大豆永46为试验材料,利用RNA-seq技术对20％ PEG6000处理不同时间的叶片进行基因表达谱差异分析.结果显示:获得39 183个序列信息,其中各时期共有序列27 875个.随干旱胁迫时间延长,差异表达基因数量发生变化,胁迫12 h达到最多.根据GO功能分析可将序列大致分为分子功能、细胞成分和生物学过程三大类,其差异表达基因广泛涉及糖、脂类、蛋白质和核酸等生物大分子代谢、能量代谢以及次生代谢过程.在KEGG数据库中,依据代谢途径可将其定位在127个分支,包括植物-病原体互作、植物激素信号转导、RNA降解、ABC转运蛋白等,其中植物激素信号转导途径在不同时间处理下的变化都显著.转录因子分析发现在于旱胁迫下变化明显的转录因子家族包括MYB、bHLH、AP2\EREBP、WRKY和NAC等.对4个不同功能基因干旱胁迫后不同时间的表达量进行荧光定量分析,其变化趋势与转录组数据相同.
The Transcriptome Analysis of Wild Soybean Under Drought Stress Simulated by PEG

张小芳、王冰冰、徐燕、张炜坤、赵恢、张锴、乔亚科、李桂兰

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河北科技师范学院农学与生物科技学院,河北昌黎066600

野生大豆 RNA-seq 干旱胁迫 转录组

转基因生物新品种培育科技重大专项河北省自然科学基金河北省自然科学基金河北省研究生创新资助项目

2014ZX0800404BC2016407100C2014407051CXZZSS2018148

2018

大豆科学
黑龙江省农业科学院

大豆科学

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子：0.641
ISSN：1000-9841
年,卷(期)：2018.37(5)
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