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大豆水溶性蛋白质的全基因组关联分析

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为进一步解析中国大豆种质水溶性蛋白的遗传基础,为大豆高水溶性蛋白质的分子标记辅助选择育种及品质改良提供理论依据,本研究以224份大豆种质为试验材料,于2017和2018年对大豆水溶性蛋白质含量进行测定,利用1 514个高质量的SNP标记分别对2017、2018年水溶性蛋白质含量及两年均值进行全基因组关联分析,共检测到18个显著关联的SNP标记,这些SNP标记涉及16个位点,有8个位点至少被检测到2次,其余8个位点仅被检测到1次,表明其受环境因素影响较大.16个位点中有7个尚未见报道,分别位于8、11、13、14和15号染色体上,是新发现的控制大豆水溶性蛋白的位点.对表型变异解释率较高且稳定关联的2个位点qWSPC7和qWSPC8-1候选区间内的基因进行预测,共获得25个候选基因,其中有7个基因(Glyma.07g195000、Glyma.08g103100、Glyma.08g108900、Glyma.08g105100、Glyma.08g107800、Glyma.08g107700和Glyma.08G115800)在大豆籽粒、根或根瘤中具有较高的表达水平.这些基因可作为水溶性蛋白质的候选基因,可能具有调控大豆水溶性蛋白质的功能.
Genome Wide Association Analysis on Water-Soluble Protein in Soybean

沈甲诚、张小利、黄建丽、邓肃霜、郭娜、赵晋铭、邢邯

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南京农业大学农学院/国家大豆改良中心/农业部大豆生物学与遗传育种重点实验室/作物遗传与种质创新国家重点实验室,江苏南京210095

大豆 水溶性蛋白质 全基因组关联分析 候选基因挖掘

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2018YFD01008002017YFD0101500KYT201801CARS-004-PS10BE2019376-2PCSIRT_17R55

2020

10.11861/j.issn.1000-9841.2020.04.0509

大豆科学
黑龙江省农业科学院

大豆科学

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子：0.641
ISSN：1000-9841
年,卷(期)：2020.39(4)
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