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大豆Glyma.05G222700.2基因生物信息学与逆境表达分析

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为研究Glyma.05G222700.2基因编码的丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶在抗非生物胁迫过程的功能和原理,促进大豆抗逆候选基因的开发利用,本研究通过生物信息学方法对大豆Glyma.05G222700.2基因进行同源序列、蛋白结构、进化树和转录组分析,通过qRT-PCR分析盐胁迫下大豆不同组织中该基因的表达情况.结果 表明:该基因编码区长2040 bp,编码697个氨基酸,预测分子量为656.54 kD,pI8.026.多序列比对发现Glyma.05 G222700.2蛋白包含1个Pkinase结构域.进化树分析表明该蛋白与野大豆、刺毛黧豆、赤豆一致性较高.转录组数据表明Glyma.05G222700.2基因在大豆各组织中均有表达,其中在种子中表达量最高,在根中表达量最低.qRT-PCR结果发现Glyma.05G222700.2基因在毛状根、茎、叶中均有表达,在茎中表达量最高,在叶中表达量最低;在毛状根中盐胁迫12 h表达量达到极值,盐胁迫24h表达量下降;在茎中表达量呈上升趋势,在24h表达量达到极值;在叶中表达量不稳定,盐胁迫2h该基因不表达,盐胁迫6h该基因表达量达到极值并高于对照,盐胁迫12和24h表达量低于对照.推断该基因可能在大豆抵抗盐胁迫过程中起到重要作用.
Bioinformatics and Expression Analysis Under Stress of Soybean Glyma.05g22700.2 Gene

刘晨、魏雅婷、于月华、倪志勇

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新疆农业大学农学院,新疆乌鲁木齐830052

大豆 Glyma.05G222700.2 生物信息学 qRT-PCR 盐胁迫

国家自然科学基金国家自然科学基金天山青年计划天山青年计划新疆农业大学校级大学生创新项目

31860295316602952018Q0182018Q002dxscx2020040

2020

10.11861/j.issn.1000-9841.2020.04.0543

大豆科学
黑龙江省农业科学院

大豆科学

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子：0.641
ISSN：1000-9841
年,卷(期)：2020.39(4)
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