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大豆胞囊线虫病抗性相关bZIP转录因子的生物信息学分析

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为分析大豆bZIP转录因子在大豆胞囊线虫病3号生理小种胁迫下的应答机制,促进大豆响应大豆胞囊线虫病3号生理小种胁迫机制的研究,本研究采用胞囊线虫病3号生理小种对抗线虫大豆品种东农L-10进行胁迫,对转录组测序数据中与抗性相关的bZIP转录因子进行在线生物信息学预测和分析.结果 共获得l8个与大豆胞囊线虫病3号生理小种相关的差异表达bZIP转录因子,不同bZIP转录因子之间的理化性质存在较大差异,大多数上调表达的bZIP转录因子为碱性等电点,而大多数下调表达的bZIP转录因子为酸性等电点;18个bZIP蛋白中含有多个丝氨酸(S)、苏氨酸(T)和酪氨酸(Y)磷酸化位点,其中丝氨酸(S)位点最多;亚细胞定位显示2个bZIP转录因子定位于叶绿体,其余均定位于细胞核,与转录因子调控下游基因的表达特性相一致;18个bZIP蛋白的系统进化树分为2大类群,其中上调表达的bZIP转录因子和下调表达的bZIP转录因子亲缘关系较远;bZIP基因家族的成员都含有数量不等的motif结构,且不同bZIP基因之间保守结构域的氨基酸存在变异;蛋白二级结构中以无规则卷曲和α-螺旋为主要构成元件;根据结构相似性,18个bZIP蛋白三级结构分为4类,不同bZIP转录因子三级结构的相似性暗示了功能上存在相似.
Bioinformatics Analysis of bZIP Transcription Factors Related to Resistance to Soybean Cyst Nematode

姜海鹏、田力峥、卜凡珊、赵雪、韩英鹏

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东北农业大学大豆研究所,黑龙江哈尔滨150030

大豆胞囊线虫病 3号生理小种 转录组测序 bZIP转录因子 生物信息学

黑龙江省杰出青年基金国家自然科学基金面上项目国家自然科学基金面上项目国家科技重大专项和重点研发项目(课题)省级资助项目黑龙江省博士后项目国家重点研发计划项目

JC20180073167171731971967GX17B002LBH-Q170152016YFD0100304

2020

10.11861/j.issn.1000-9841.2020.05.0703

大豆科学
黑龙江省农业科学院

大豆科学

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子：0.641
ISSN：1000-9841
年,卷(期)：2020.39(5)
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