首页|大豆响应涝害bZIP基因Glyma04g04170的生物信息学分析及互作蛋白预测

大豆响应涝害bZIP基因Glyma04g04170的生物信息学分析及互作蛋白预测

扫码查看
原文链接
  • 国家科技期刊平台
  • NETL
  • NSTL
  • 万方数据
  • 维普
bZIP转录因子参与多种非生物胁迫,为研究涝害胁迫下大豆bZIP转录因子的调控作用,本研究对耐涝性极强大豆品种齐黄34进行淹水处理,对处理不同时间根部组织样品进行转录组测序,筛选出1个响应耐涝的差异表达的bZIP转录因子编码基因Glyma04 g04170,其qRT-PCR分析结果与转录组测序数据趋势一致,在4个取样时间点都下调表达,证明该转录组数据具有可靠性,Glyma04g04170可能通过负调控的方式参与大豆耐涝应答反应.Glyma04g04170蛋白保守结构域分析发现该蛋白内部含有bZIP保守结构域.蛋白三级结构中存在参与寡聚化作用的亮氨酸拉链保守结构域,同时也包含与特异DNA序列相结合、起核定位信号作用的N-x7-R/K结构.分离鉴定的Glyma04g04170蛋白是一个结合AREB/ABF的bZIP转录因子,预测结果显示,与该蛋白互作的蛋白主要是丝氨酸/苏氨酸残基蛋白磷酸酶.转录组和RT-qPCR数据表明,Glyma02g37090基因在4个取样时间点的表达量都呈显著性差异,处理与对照相比,表达量升高.
Bioinformatics Analysis and Interacting Protein Prediction of Soybean bZIP Gene GlymaO4g04170 in Response to Submergence Stress

林延慧、唐力琼、徐靖、朱红林、王新华、王敏芬、徐冉、王效宁

展开 >

海南省农业科学院粮食作物研究所/海南省农作物遗传育种重点实验室/农业部作物基因资源与种质创制海南科学观测实验站,海南海口571100

山东省农业科学院作物研究所,山东济南250100

大豆 耐涝 转录组 bZIP转录因子

2019年海南省基础与应用基础研究计划(自然科学领域)高层次人才项目山东省农业良种工程项目

2019RC3572019LZGC004

2020

10.11861/j.issn.1000-9841.2020.05.0727

大豆科学
黑龙江省农业科学院

大豆科学

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子：0.641
ISSN：1000-9841
年,卷(期)：2020.39(5)
  • 5
  • 1