大豆科学2021,Vol.40Issue(3) :309-318.DOI:10.11861/j.issn.1000-9841.2021.03.0309

大豆phyA下游基因预测和表达分析及敲除载体构建

Soybean phyA Downstream Gene Prediction and Expression Analysis and Its Knockout Vector Construction

张婷 马丽欣 刘俊 林晓雅 刘宝辉
大豆科学2021,Vol.40Issue(3) :309-318.DOI:10.11861/j.issn.1000-9841.2021.03.0309

大豆phyA下游基因预测和表达分析及敲除载体构建

Soybean phyA Downstream Gene Prediction and Expression Analysis and Its Knockout Vector Construction

张婷 1马丽欣 1刘俊 1林晓雅 1刘宝辉1
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作者信息

  • 1. 广州大学分子遗传与进化研究中心/广州市重点实验室,广东广州510006
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摘要

为了进一步研究大豆光周期调控通路中E3和E4的下游基因,为获得其突变体植株奠定基础,以拟南芥远红光响应受体phyA下游的重要信号传递因子PIF3、LAF1、FHY1和FHL的序列作为参考序列,在Phytozome 12数据库中查找其相似序列,进行序列比对和进化树分析,确定它们在大豆中的同源基因并采用qRT-PCR方法进行组织表达分析,使用CRISPR/Cas 9系统设计同源基因的敲除靶点并通过发根系统验证靶点的有效性.结果 显示:AtPIF3在大豆中有6个同源基因,AtLAF1在大豆中有4个同源基因,AtFHL在大豆中有2个同源基因,而AtFHY1在大豆中没有同源基因.4个LAF1基因主要在顶端生长点表达,6个PIF3和2个FHL基因主要在荚中表达.共鉴定出12个有效靶点,能够分别将大豆中6个PIF3、4个LAF1和2个FHL基因成功敲除.研究结果为进一步获得稳定的大豆突变体材料和大豆phyA下游基因的功能研究提供了理论基础.

关键词

大豆/PIF3/LAF1/FHL/组织表达分析/CRISPR/Cas9/基因敲除载体

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基金项目

广州市科技计划(202002030180)

出版年

2021
大豆科学
黑龙江省农业科学院

大豆科学

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子:0.641
ISSN:1000-9841
被引量1
参考文献量4
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