大豆科学2021，Vol.40Issue(3) ：319-326.DOI:10.11861/j.issn.1000-9841.2021.03.0319

大豆耐涝bHLH转录因子筛选及生物信息学分析

Selection and Bioinformatics Analysis of bHLH Transcription Factor Response to Submergence Stress in Soybean

林延慧 徐冉 朱红林 唐力琼 侯本军 徐靖
大豆科学2021，Vol.40Issue(3) ：319-326.DOI:10.11861/j.issn.1000-9841.2021.03.0319
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大豆耐涝bHLH转录因子筛选及生物信息学分析

Selection and Bioinformatics Analysis of bHLH Transcription Factor Response to Submergence Stress in Soybean

林延慧 1徐冉 2朱红林 1唐力琼 1侯本军 1徐靖1
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作者信息

  • 1. 海南省农业科学院粮食作物研究所/海南省农作物遗传育种重点实验室/农业部作物基因资源与种质创制海南科学观测实验站,海南海口571100
  • 2. 山东省农业科学院作物研究所,山东济南250100
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摘要

为研究大豆bHLH转录因子与涝害响应相关性,为大豆耐涝性研究提供理论基础,本研究对强耐涝性品种齐黄34进行没顶淹水处理,分析转录组测序结果,筛选差异表达的bHLH转录因子并对其进行生物信息学分析,采用荧光定量PCR方法验证主要差异表达bHLH转录因子编码基因的表达情况,并通过生物信息学方法分析基因结构和互作蛋白.结果 显示:涝害胁迫下共发现7个差异表达的bHLH转录因子,它们的同源性并不高,属于不同类型的bHLH.主要差异表达bHLH基因GmbHLH25-15(Glyma.15 G06680)的表达量变化情况与转录组数据趋势一致,呈现下调表达.预测到10个蛋白可与该蛋白互作,互作蛋白都是铵转运蛋白,其中4个蛋白编码基因的表达量在转录组测序结果中呈现显著性差异.推测在无氧条件下,GmbHLH25-15可能通过调控铵转运蛋白进而调节铵态氮的吸收来供给自身营养,进而抵御涝害胁迫.

关键词

大豆/耐涝/转录组/bHLH转录因子/GmbHLH25-15/铵转运蛋白

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基金项目

2020年海南省省属科研院所技术创新专项(jscx202004)

2019年海南省基础与应用基础研究计划(自然科学领域)高层次人才项目(2019RC357)

出版年

2021
大豆科学
黑龙江省农业科学院

大豆科学

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子：0.641
ISSN：1000-9841
被引量1
参考文献量3
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