大豆科学2021，Vol.40Issue(4) ：476-481,489.DOI:10.11861/j.issn.1000-9841.2021.04.0476

大豆GmNCED5基因非生物胁迫响应及生物信息学分析

Response of Soybean GmNCED5 Gene Under Abiotic Stress and Its Bioinformatics Analysis

朱琨 翟莹 于海伟 张军 邱爽 何佳琦 李铭杨
大豆科学2021，Vol.40Issue(4) ：476-481,489.DOI:10.11861/j.issn.1000-9841.2021.04.0476
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大豆GmNCED5基因非生物胁迫响应及生物信息学分析

Response of Soybean GmNCED5 Gene Under Abiotic Stress and Its Bioinformatics Analysis

朱琨 1翟莹 1于海伟 1张军 2邱爽 1何佳琦 1李铭杨1
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作者信息

  • 1. 齐齐哈尔大学生命科学与农林学院,黑龙江齐齐哈尔161006
  • 2. 黑龙江省农业科学院畜牧兽医分院,黑龙江齐齐哈尔161005
  • 折叠

摘要

为探究大豆9-顺式-环氧类胡萝卜素双加氧酶(NCED)基因GmNCED5对非生物胁迫的响应及原理,为植物基因工程及大豆抗逆育种提供理论基础,本研究检测GmNCED5在非生物胁迫下的表达量,并对该基因及其启动子序列进行生物信息学分析.实时荧光定量PCR结果显示,干旱、高盐、高温、低温及外源脱落酸(ABA)处理均可以不同程度地诱导GmNCED5在大豆幼苗中表达.GmNCED5基因开放阅读框(ORF)全长1 686 bp,编码561个氨基酸.亚细胞定位预测结果显示,GmNCED5蛋白主要定位于细胞质中.系统进化分析表明GmNCED5蛋白与豇豆VuNCED蛋白的亲缘关系最近.启动子预测分析结果显示,GmNCED5启动子区域含有5种激素响应相关顺式作用元件和3种胁迫响应相关顺式作用元件.由此推测GmNCED5可能通过启动子区域的顺式作用元件响应非生物胁迫.

关键词

大豆/GmNCED5/非生物胁迫/表达分析/生物信息学分析/顺式作用元件

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基金项目

出版年

2021
大豆科学
黑龙江省农业科学院

大豆科学

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子：0.641
ISSN：1000-9841
被引量1
参考文献量6
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