大豆科学2021，Vol.40Issue(5) ：602-611.DOI:10.11861/j.issn.1000-9841.2021.05.0602

大豆BBX32基因生物信息学分析及基因编辑靶点设计

Bioinformatics Analysis and Gene Editing Target Design of BBX32 Gene in Soybean

李泰 杜浩 黎永力 程玉汉 南海洋 侯智红 程群 刘宝辉
大豆科学2021，Vol.40Issue(5) ：602-611.DOI:10.11861/j.issn.1000-9841.2021.05.0602
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大豆BBX32基因生物信息学分析及基因编辑靶点设计

Bioinformatics Analysis and Gene Editing Target Design of BBX32 Gene in Soybean

李泰 1杜浩 1黎永力 1程玉汉 2南海洋 1侯智红 1程群 1刘宝辉1
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作者信息

  • 1. 广州大学生命科学学院,广东广州510006
  • 2. 北京中农富通园艺有限公司,北京100083
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摘要

BBX32基因是一种含锌指结构的转录因子,广泛的参与植物生长和发育过程,但在大豆中,BBX32基因的具体生物学功能还尚未被解析.为研究大豆BBX32基因在大豆中的分子机理和生物学功能,本研究通过同源比对分析发现,大豆中含有两个与拟南芥BBX32同源的基因,分别命名为GmBBX32a和GmBBX32b.同时,通过检索RNA-seq数据库,对GmBBX32a和GmBBX32b在大豆中不同组织的表达部位进行分析,结果发现GmBBX32a在花、叶和豆荚中具有较高的表达量,而GmBBX32b在豆荚和花中具有较高的表达量,说明GmBBX32a和GmBBX32b可能参与大豆的开花和籽粒大小形成.此外,利用CRISPR/Cas9技术,构建GmBBX32a和GmBBX32b基因的敲除载体,并转化到大豆毛根中进行靶点检测,最终获得了有编辑效率的基因编辑载体,为接下来获得稳定转基因材料提供有效编辑靶点信息.

关键词

大豆/BBX32基因/生物信息学分析/CRISPR/Cas9技术/编辑靶点

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基金项目

出版年

2021
大豆科学
黑龙江省农业科学院

大豆科学

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子：0.641
ISSN：1000-9841
被引量2
参考文献量12
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