大豆科学2021,Vol.40Issue(5) :612-619.DOI:10.11861/j.issn.1000-9841.2021.05.0612

大豆GmPM31基因生物信息学、组织表达及高温高湿响应分析

Analysis of Soybean GmPM31 Bioinformatics,Tissue Expression and Response to High Temperature and High Humidity

刘骕骦 邱颖胜 刘燕敏 李阳 魏家萍 沈英姿 吴酬飞
大豆科学2021,Vol.40Issue(5) :612-619.DOI:10.11861/j.issn.1000-9841.2021.05.0612

大豆GmPM31基因生物信息学、组织表达及高温高湿响应分析

Analysis of Soybean GmPM31 Bioinformatics,Tissue Expression and Response to High Temperature and High Humidity

刘骕骦 1邱颖胜 1刘燕敏 1李阳 2魏家萍 3沈英姿 4吴酬飞2
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作者信息

  • 1. 湖州学院理工学院,浙江湖州313000
  • 2. 湖州师范学院生命科学学院,浙江湖州313000
  • 3. 甘肃农业大学农学院/农作物生物学国家重点实验室,甘肃兰州730070
  • 4. 南京农业大学农学院/作物遗传与种质创新国家重点实验室,江苏南京210095
  • 折叠

摘要

sHSPs家族基因GmPM31具有典型的ACD结构域,为了预测和研究GmPM31的功能,本研究以田间劣变抗性春大豆湘豆3号为材料,分离GmPM31及其启动子序列,对该基因的结构及启动子上的顺式作用元件进行生物信息学分析,采用qRT-PCR方法对GmPM31的组织表达模式及高温高湿处理下的表达量变化进行分析.结果 表明:GmPM31基因的ORF全长为459 bp,编码153个氨基酸,包含1个ACD保守域结构.蛋白质系统进化树分析结果显示,GmPM31与CI(Class Ⅰ)亚家族的sHSPs同源性较高,表明GmPM31属于Class Ⅰ sHSPs家族成员.GmPM31基因启动子中有多个逆境胁迫响应元件,包括激素应答相关元件ABRE、ERE和AAGAA-motif等,干旱和冷胁迫相关的MYB和MYC转录因子作用元件,高盐胁迫相关元件Box Ⅲ,厌氧胁迫相关元件ARE等.qRT-PCR结果显示,GmPM31在成熟种子中大量表达,其次在幼荚和叶片中表达,在根、茎和花中表达量极低.种子发育过程中,GmPM31表达量呈现先上升后下降的趋势,在开花后第45天表达量达到最大.高温高湿胁迫处理96和168 h时种子中GmPM31的表达量显著高于对照组,说明高温高湿胁迫诱导种子中GmPM31上调表达.研究结果表明GmPM31参与了春大豆种子的发育以及高温高湿胁迫响应过程.

关键词

春大豆/GmPM31/生物信息学分析/顺式作用元件/表达/种子/高温高湿

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基金项目

出版年

2021
大豆科学
黑龙江省农业科学院

大豆科学

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子:0.641
ISSN:1000-9841
被引量3
参考文献量5
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