大豆科学2021，Vol.40Issue(6) ：748-758.DOI:10.11861/j.issn.1000-9841.2021.06.0748

大豆ERF家族基因生物信息学分析及其对低磷胁迫的响应

Bioinformatics Analysis on Soybean ERF Family Genes and Their Response to Low Phosphorus Stress

孙崇源 崔瑞凡 王瑞阳 刘小倩 许焕青 杨宇明 吕海燕 张丹
大豆科学2021，Vol.40Issue(6) ：748-758.DOI:10.11861/j.issn.1000-9841.2021.06.0748
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大豆ERF家族基因生物信息学分析及其对低磷胁迫的响应

Bioinformatics Analysis on Soybean ERF Family Genes and Their Response to Low Phosphorus Stress

孙崇源 1崔瑞凡 1王瑞阳 1刘小倩 1许焕青 1杨宇明 1吕海燕 1张丹1
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作者信息

  • 1. 河南农业大学农学院,河南郑州450002
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摘要

为分析大豆乙烯响应因子(Ethylene Response Factor,ERF)基因家族的特征及其在低磷胁迫下的响应作用,本研究首先利用生物信息学方法从大豆基因组数据库中鉴定获得ERF家族基因,进行进化分析、染色体分布和基因结构分析,并研究其在大豆发育过程中不同组织的表达模式及在低磷胁迫下的表达情况.结果显示:59个大豆ERF家族基因分布在除4号染色体外的整个大豆染色体组上,其中3号、10号、13号、18号和19号染色体分布较多.基因结构分析显示整个家族具有典型的AP2结构域.同源序列比对和进化分析将该家族的基因分为4组,分别包括15,5,19和20个基因.基于Soybase数据库的组织表达分析表明该家族基因在大豆的不同组织中均有表达;qRT-PCR结果表明该家族基因低磷胁迫条件下的大豆根、茎和叶中均被诱导表达.结果说明大豆ERF基因结构较保守,能够参与低磷胁迫响应.

关键词

大豆/ERF基因家族/生物信息学/低磷胁迫

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基金项目

国家自然科学基金(32072088)

河南省科技攻关计划(202102110005)

出版年

2021
大豆科学
黑龙江省农业科学院

大豆科学

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子：0.641
ISSN：1000-9841
被引量2
参考文献量4
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