大豆科学2022,Vol.41Issue(1) :1-11.DOI:10.11861/j.issn.1000-9841.2022.01.0001

大豆ELF3的生物信息学分析及GmELF3Ld功能初探

Bioinformatics Analysis of GmELF3 and Preliminary Study on the Function of GmELF3 Ld

李佳雯 张帅锋 吴庚雪 吴红霞 杨龙 岳岩磊
大豆科学2022,Vol.41Issue(1) :1-11.DOI:10.11861/j.issn.1000-9841.2022.01.0001

大豆ELF3的生物信息学分析及GmELF3Ld功能初探

Bioinformatics Analysis of GmELF3 and Preliminary Study on the Function of GmELF3 Ld

李佳雯 1张帅锋 2吴庚雪 1吴红霞 1杨龙 1岳岩磊1
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作者信息

  • 1. 河南农业大学 生命科学学院,河南 郑州450002
  • 2. 河南农业大学 资源与环境学院,河南 郑州450002
  • 折叠

摘要

ELF3是生物节律钟重要的组成部分,在植物的生长发育中发挥重要作用.大豆是光周期敏感的短日作物,含有5个ELF3同源基因,其中GmELF3a/J是引起大豆绿色革命的明星基因,主要调控大豆童期的发育.为分析其他4个GmELF3同源基因的功能,本研究利用MEGA⁃X、Multalin SOPMA和ExPASy⁃Prot Param等工具对它们的进化关系、蛋白功能、特性、亚细胞定位及基因表达情况进行生物信息学分析,同时通过转化拟南芥初步研究GmELF3Ld的功能.结果表明:大豆中5个ELF3基因可以分为两类,其中GmELF3a/J、GmELF3b和GmELF3c为A类,GmELF3Ld和GmELF3Le为B类.GmELF3Le的α螺旋含量及不稳定性指数均为最高.另外,这5个蛋白均为亲水性非跨膜蛋白,含有多个丝氨酸和酪氨酸磷酸化位点,为蛋白活性调控提供条件.B类基因表达量远高于A类且表现出明显的营养器官与生殖器官分化,即GmELF3b和GmELF3c基因在花和种子中高表达,GmELF3Ld和GmELF3Le则在叶片中高表达.转基因拟南芥研究结果表明,GmELF3Ld抑制拟南芥开花关键基因FT和CO的表达,延迟拟南芥的花期.本研究结果表明两类GmELF3同源蛋白具有不同的生物学功能,GmELF3Ld延迟拟南芥的花期.

关键词

大豆/ELF3/生物信息学/GmELF3Ld/拟南芥/转基因

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基金项目

国家自然科学基金(32001573)

河南农业大学青年英才项目(30500613)

出版年

2022
大豆科学
黑龙江省农业科学院

大豆科学

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子:0.641
ISSN:1000-9841
参考文献量2
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