大豆科学2022,Vol.41Issue(1) :12-19.DOI:10.11861/j.issn.1000-9841.2022.01.0012

大豆TGL基因家族全基因组鉴定及高盐胁迫响应研究

Genome⁃Wide Identification of Soybean TGL Gene Family and The Response to High Salt Stress

王晓丽 王敏 岳爱琴 赵晋忠 王利祥 张永坡 高春艳 杜维俊
大豆科学2022,Vol.41Issue(1) :12-19.DOI:10.11861/j.issn.1000-9841.2022.01.0012

大豆TGL基因家族全基因组鉴定及高盐胁迫响应研究

Genome⁃Wide Identification of Soybean TGL Gene Family and The Response to High Salt Stress

王晓丽 1王敏 1岳爱琴 1赵晋忠 2王利祥 1张永坡 2高春艳 2杜维俊1
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作者信息

  • 1. 山西农业大学 农学院,山西 太谷030800
  • 2. 山西农业大学 基础部,山西 太谷030800
  • 折叠

摘要

三酰甘油脂肪酶(TGL)是甘油三脂分解代谢的主要酶,TGLs能水解参与植物生长发育和非生物胁迫反应的长链脂肪酸甘油三酯(TAG).为研究大豆TGL基因家族的基因成员及其对高盐胁迫的响应,本研究通过同源比对方法在大豆中鉴定GmTGLs基因并对其进行生物信息学分析,根据RNA⁃seq数据库并采用荧光定量PCR方法分析盐胁迫下基因的表达量差异,并对主要盐胁迫响应基因进行生物信息学分析.结果显示:共从大豆中鉴定出15个GmTGLs基因,不均匀地分布在11条染色体上,其编码氨基酸序列为392~701 aa.这些GmTGLs均有保守结构域Abhydro_lipase(PF04083).启动子顺式作用元件分析表明,GmTGLs的启动子包含光响应顺式元件,激素响应元件及ARE、LTR、TC⁃rich repeats和MBS等胁迫响应元件.转录组数据分析表明GmTGL3、GmTGL14基因在所有组织中均有表达,GmTGL3、GmTGL14、GmTGL2和GmTGL6基因在盐胁迫后表达上调,GmTGL2和GmTGL3基因的表达变化最明显.荧光定量PCR分析结果表明GmTGL2和GmTGL3可能分别主要在盐胁迫的后期和前期参与响应,进一步证实TGL基因家族参与了大豆对盐胁迫的反应过程.

关键词

大豆/三酰基甘油脂肪酶/生物信息学分析/高盐胁迫/表达分析

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基金项目

山西农业大学省部共建有机旱作农业国家重点实验室自主研发项目(202105D121008?3?8)

山西农业大学育种工程项目(YZGC096)

山西省自然科学基金(201901D111225)

山西农业大学农学院育种工程重点培育专项(YZ2021?05)

出版年

2022
大豆科学
黑龙江省农业科学院

大豆科学

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子:0.641
ISSN:1000-9841
被引量1
参考文献量4
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