大豆科学2022，Vol.41Issue(1) ：20-27.DOI:10.11861/j.issn.1000-9841.2022.01.0020

大豆GmNF?YB2基因生物信息学和表达分析及与GmNF?YA10互作鉴定

Bioinformatics and Expression Analysis of Soybean GmNF⁃YB2 Gene and Interaction Identification of GmNF⁃YA10

赵国勤 王怡 于月华 倪志勇
大豆科学2022，Vol.41Issue(1) ：20-27.DOI:10.11861/j.issn.1000-9841.2022.01.0020
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大豆GmNF?YB2基因生物信息学和表达分析及与GmNF?YA10互作鉴定

Bioinformatics and Expression Analysis of Soybean GmNF⁃YB2 Gene and Interaction Identification of GmNF⁃YA10

赵国勤 1王怡 2于月华 2倪志勇1
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作者信息

  • 1. 新疆农业大学 生命科学学院,新疆 乌鲁木齐830052
  • 2. 新疆农业大学 农学院,新疆 乌鲁木齐830052
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摘要

NF⁃Y三聚体复合物是由NF⁃YA、NF⁃YB和NF⁃YC 3个不同亚基组成,为探究大豆GmNF⁃YB2亚基在NF⁃Y三聚体复合物中的作用及其对干旱胁迫的响应,本研究克隆GmNF⁃YB2基因,对其进行生物信息学分析和表达模式分析,并鉴定GmNF⁃YA10与GmNF⁃YB2蛋白之间的互作关系.结果表明:GmNF⁃YB2基因序列全长1109 bp,编码区长498 bp,编码165个氨基酸.预测该蛋白分子量为18.19 kD,理论等电点6.10,进化树分析发现其与AtNF⁃YB2和AtNF⁃YB3处于同一分支.转录组数据和组织表达模式分析发现GmNF⁃YB2基因在检测的所有组织中均有表达,其中在子叶和叶片中的表达量较高;干旱胁迫时叶片中的表达量降低.酵母双杂交分析表明GmNF⁃YA10和GmNF⁃YB2之间不存在蛋白互作关系.

关键词

大豆/GmNF⁃YB2/生物信息学/组织/干旱/表达/蛋白互作

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基金项目

国家自然科学基金(32160446)

国家自然科学基金(31860295)

新疆维吾尔自治区自然科学基金(2021D01A93)

自治区天山创新团队计划(2020D14002)

天山青年计划(2018Q018)

天山青年计划(2018Q002)

出版年

2022
大豆科学
黑龙江省农业科学院

大豆科学

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子：0.641
ISSN：1000-9841
参考文献量12
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