大豆科学2022，Vol.41Issue(1) ：36-42.DOI:10.11861/j.issn.1000-9841.2022.01.0036

大豆干旱响应GRAS基因筛选及GmGRAS27的生物信息学和逆境表达分析

Screening of Soybean Drought Responsive GRAS Genes and Bioinformatics and Adversity Stress Expression Analysis on GmGRAS27

刘薇 张彦威 王玉斌 李伟 徐冉 王彩洁 张礼凤
大豆科学2022，Vol.41Issue(1) ：36-42.DOI:10.11861/j.issn.1000-9841.2022.01.0036
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大豆干旱响应GRAS基因筛选及GmGRAS27的生物信息学和逆境表达分析

Screening of Soybean Drought Responsive GRAS Genes and Bioinformatics and Adversity Stress Expression Analysis on GmGRAS27

刘薇 1张彦威 1王玉斌 1李伟 1徐冉 1王彩洁 1张礼凤1
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作者信息

  • 1. 山东省农业科学院 作物研究所/山东省特色作物工程实验室,山东 济南250100
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摘要

GRAS转录因子在植物抵抗非生物胁迫过程中发挥了重要作用,为了研究大豆GRAS基因在干旱胁迫中的响应,以挖掘大豆GRAS转录因子在干旱等非生物胁迫响应中的功能和分子机制提供分子基础,本研究利用基因表达综合数据库(Gene Expression Omnibus,GEO)筛选响应干旱胁迫的大豆GRAS基因,利用PlantCARE分析其启动子中的顺式作用元件.进一步对在营养生长时期(V6)和盛花期(R2)均受到干旱胁迫强烈诱导的GRAS基因GmGRAS27进行克隆和生物信息学分析,并采用实时荧光定量PCR方法分析干旱、盐和ABA胁迫下GmGRAS27基因的表达情况.结果显示:从大豆117个GRAS基因中筛选出10个响应干旱胁迫的GRAS基因,其启动子序列中均至少含有1个激素或逆境胁迫应答相关元件,GmGRAS27(Glyma.06G265500)基因的启动子同时含有ABRE应答元件和MYB/MYC结合元件.GmGRAS27在V6和R2期均受到干旱胁迫的强烈诱导,其编码的蛋白质GmGRAS27含有典型的GRAS基因家族结构域,高级结构以α⁃螺旋和无规则卷曲为主.实时荧光定量PCR分析显示GmGRAS27不仅受到干旱胁迫的强烈诱导,还受到盐胁迫和ABA的正向调控.推测GmGRAS27不仅是大豆干旱胁迫的重要候选基因也可能响应其他非生物胁迫.

关键词

大豆/干旱/GRAS/GmGRAS27/生物信息学/逆境胁迫/表达分析

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基金项目

山东省农科院农业科技创新工程项目(CXGC2021A30)

山东省自然科学基金青年项目(ZR2020QC119)

山东省农科院农业科技创新工程项目(CXGC2018E01)

山东省农业良种工程项目(2019LZGC004)

出版年

2022
大豆科学
黑龙江省农业科学院

大豆科学

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子：0.641
ISSN：1000-9841
被引量3
参考文献量2
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