大豆科学2022,Vol.41Issue(4) :427-437.DOI:10.11861/j.issn.1000-9841.2022.04.0427

大豆FLC-like基因生物信息学分析及开花调控功能解析

Bioinformatics Analysis and Flowering Regulation Function Analysis of FLC-like Genes in Soybean

杨璧泽 刘宝辉 汤杨
大豆科学2022,Vol.41Issue(4) :427-437.DOI:10.11861/j.issn.1000-9841.2022.04.0427

大豆FLC-like基因生物信息学分析及开花调控功能解析

Bioinformatics Analysis and Flowering Regulation Function Analysis of FLC-like Genes in Soybean

杨璧泽 1刘宝辉 1汤杨1
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作者信息

  • 1. 广州大学生命科学学院,广东广州510006
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摘要

FLC基因编码蛋白是植物开花春化途径中的核心抑制因子,属于MADS-box家族.大豆是不需要春化的作物,大豆FLC基因的功能还有待进一步研究.为了解析大豆FLC基因在开花调控中的功能,本研究利用生物信息学方法对大豆FLC基因进行同源比对分析、蛋白结构分析和组织特异性表达分析,同时验证大豆FLC不同单倍型的开花时间.结果表明:在128个大豆MADS-box基因中鉴定出2个大豆FLC-like基因,GmFLC-like 1(Glyma.05G148700)和 GmFLC-like 2(Glyma.08G105400),其中 GmFLC-like 2 为新发现的大豆 FLC 基因.GmFLC-like 1 和 GmFLC-like 2 均具有1个高度保守的MADS-box结构域、1个较为保守的K-box结构域和不保守的C末端结构域.GmFLC-like 1在叶片、花和果荚的表达量较高,GmFLC-like 2在花、果荚、根和根瘤中表达量较高.通过把424份大豆自然群体材料中GmFLC-like的单倍型与开花期关联分析发现,GmFLC-like1的外显子与GmFLC-like 1和GmFLC-like 2的内含子分别发生单碱基突变后,开花期都显著延迟,表明GmFLC-like 1和GmFLC-like 2可能参与大豆开花期的调控.

关键词

大豆/FLC-like/生物信息学/单倍型/开花期

引用本文复制引用

基金项目

出版年

2022
大豆科学
黑龙江省农业科学院

大豆科学

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子:0.641
ISSN:1000-9841
被引量2
参考文献量1
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