大豆科学2023，Vol.42Issue(2) ：182-187.DOI:10.11861/j.issn.1000-9841.2023.02.0182

大豆Glyma04G227700生物信息学分析及与Glyma08G11030互作研究

Bioinformatics Analysis of Soybean Glyma04G227700 and Studies of Interaction with Glyma08G11030

罗飞 刘灿 于月华 倪志勇
大豆科学2023，Vol.42Issue(2) ：182-187.DOI:10.11861/j.issn.1000-9841.2023.02.0182
✕
  • 国家科技期刊平台
  • NETL
  • NSTL
  • 维普
  • 万方数据

大豆Glyma04G227700生物信息学分析及与Glyma08G11030互作研究

Bioinformatics Analysis of Soybean Glyma04G227700 and Studies of Interaction with Glyma08G11030

罗飞 1刘灿 1于月华 2倪志勇1
扫码查看

作者信息

  • 1. 新疆农业大学生命科学学院,新疆乌鲁木齐830052
  • 2. 新疆农业大学农学院,新疆乌鲁木齐830052
  • 折叠

摘要

咖啡酸-O-甲基转移酶(caffeic acid-O-methyltransferase,COMT)是一种催化苯丙素类化合物羟基上氧原子的甲基化酶.前期研究表明,大豆抵御干旱胁迫的F-box基因Glyma08G11030编码蛋白可能与COMT蛋白Glyma04G227700发生互作,为了预测分析大豆COMT基因Glyma04G227700的功能及二者的互作关系,本研究克隆Glyma04G227700基因,并对其进行生物信息学分析,通过实时荧光定量检测方法分析其在大豆不同组织中的表达情况,并利用酵母双杂交系统验证蛋白互作情况.结果显示:Glymaa04G227700基因全长1 095 bp,编码366个氨基酸,与野大豆(RZC17879.1 Glycine soja)亲缘关系较近.Glyma04G227700在大豆的根、茎、叶、子叶中都有表达,且在根和茎中表达量较高,在子叶中表达量最低.酵母双杂结果表明Glyma08G11030与Glyma04G227700蛋白不存在互作.

关键词

大豆/咖啡酸-0-甲基转移酶(COMT)/Glyma04G227700/基因克隆/生物信息学分析/酵母双杂/Glyma08G11030

引用本文复制引用

基金项目

新疆维吾尔自治区自然科学基金资助项目(2021D01A93)

出版年

2023
大豆科学
黑龙江省农业科学院

大豆科学

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子：0.641
ISSN：1000-9841
被引量1
参考文献量12
段落导航相关论文