大豆科学2023，Vol.42Issue(3) ：298-303.DOI:10.11861/j.issn.1000-9841.2023.03.0298

大豆GmNAC46生物信息学、转录自激活及组织表达分析

Bioinformatics,Autoactivation,and Tissue Expression Analysis of Soybean GmNAC46

杨梦诗 倪志勇 于月华
大豆科学2023，Vol.42Issue(3) ：298-303.DOI:10.11861/j.issn.1000-9841.2023.03.0298
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大豆GmNAC46生物信息学、转录自激活及组织表达分析

Bioinformatics,Autoactivation,and Tissue Expression Analysis of Soybean GmNAC46

杨梦诗 1倪志勇 2于月华1
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作者信息

  • 1. 新疆农业大学农学院,新疆乌鲁木齐830052
  • 2. 新疆农业大学生命科学学院,新疆乌鲁木齐830052
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摘要

NAC转录因子是一类广泛存在于植物中且为植物所特有的转录因子超家族,不仅调控植物的生长发育等方面,同时也响应植物受到的生物及非生物胁迫.为了研究大豆中NAC转录因子的功能,利用PCR的方法从大豆中克隆GmN4C46基因,采用生物信息学方法对该基因及编码的蛋白质进行分析,采用酵母单杂交实验分析转录因子的自激活活性,采用qRT-PCR的方法分析基因的组织特异性表达.结果表明:GmNAC46基因开放阅读框长1 218 bp,编码405个氨基酸,蛋白质分子量为45.872 kD,等电点为4.88.GmNAC46蛋白在4～156位氨基酸处含有1个高度保守的NAC结构域,属于亲水性蛋白,定位于细胞核中.GmNAC46蛋白与野生大豆的NAC蛋白亲缘关系较近.酵母单杂交实验结果表明,转录因子GmNAC46具有转录自激活活性.组织特异性表达模式分析表明,GmNAC46基因在大豆根、茎、叶、子叶中都表达,在根中表达量最高.

关键词

大豆/GmNAC46/基因克隆/生物信息学分析/转录激活/组织表达

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基金项目

新疆维吾尔自治区自然科学基金(2022D01E14)

新疆维吾尔自治区自然科学基金(2021D01A93)

国家自然科学基金(32160446)

国家自然科学基金(31860295)

出版年

2023
大豆科学
黑龙江省农业科学院

大豆科学

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子：0.641
ISSN：1000-9841
参考文献量10
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