大豆科学2023,Vol.42Issue(4) :396-405.DOI:10.11861/j.issn.1000-9841.2023.04.0396

脂肪酸去饱和酶FAD3蛋白特征及其在大豆中的遗传演化分析

Protein Feature and Genetic Evolution Analysis of Fatty Acid Desaturase FAD3 in Soybean

李战 王影 于莉莉 陈伊洁 于欢 王俊 邱丽娟
大豆科学2023,Vol.42Issue(4) :396-405.DOI:10.11861/j.issn.1000-9841.2023.04.0396

脂肪酸去饱和酶FAD3蛋白特征及其在大豆中的遗传演化分析

Protein Feature and Genetic Evolution Analysis of Fatty Acid Desaturase FAD3 in Soybean

李战 1王影 2于莉莉 2陈伊洁 1于欢 1王俊 1邱丽娟2
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作者信息

  • 1. 长江大学农学院/农业农村部长江中游作物绿色高效生产重点实验室(部省共建),湖北荆州434025
  • 2. 中国农业科学院作物科学研究所/农作物基因资源与基因改良国家重大科学工程,北京100081
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摘要

微体ω-3脂肪酸去饱和酶(Fatty Acid Desaturase 3,FAD3)是植物种子α-亚麻酸生物合成的关键酶.尽管很多FAD3基因被分离和鉴定,植物FAD3蛋白结构特征及遗传演化研究较少.为了探究脂肪酸去饱和酶FAD3蛋白特征及其在大豆中的遗传演化情况,本研究分析了 37个物种(包括33种植物、2种蓝藻和2种真菌)的51个FAD3蛋白的序列特征和进化关系,并分析了大豆3个GmFAD3(GmFAD3A、GmFAD3B和GmFAD3C)基因在598份材料中的单倍型及其编码蛋白构象.结果发现,植物FAD3蛋白序列和结构较为保守,其进化关系与植物分化进程一致.GmFAD3A、GmFAD3B和GmFAD3C分别包含14,4和4种单倍型.GmFAD3A-1(Hap1/2)在各大豆种植区域均有分布,Hap3/4/5除华南和西北地区外,其他地区均有分布.虽然GmFAD3A-1(Hap1/2/4)和GmFAD3A-1(Hap3/5)编码蛋白构象差异较大,但可能与地理分布并无关联.而GmFAD3A-2(Hap1~5)编码蛋白构象基本相同,表明GmFAD3A-2可能并未受到选择.GmFAD3B(Hap1/2/4)中地方品种占比较高,其中Hap1/2在我国各大豆主要产区均有分布,而Hap3中改良品种占比较高(78.57%),仅分布在东北、华北和华东地区,表明GmFAD3B(Hap1/2/4)和GmFAD3B(Hap3)编码蛋白构象差异可能受地理因素影响的同时受到人工选择.GmFAD3C中Hap1占比极高(98.66%),在我国各大豆种植区域均有分布,说明该基因比较保守,可能在大豆脂肪酸去饱和过程中起到非常重要的作用.本研究为GmFAD3在大豆α-亚麻酸积累中的作用机制解析和高α-亚麻酸育种提供参考.

关键词

GmFAD3/α-亚麻酸/大豆/蛋白结构/单倍型分析

Key words

GmFAD3/α-linolenic acid/soybean/protein structure/haplotype analysis

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基金项目

中国农业科学院农业科技创新工程(CAAS-ASTIP)项目()

出版年

2023
大豆科学
黑龙江省农业科学院

大豆科学

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子:0.641
ISSN:1000-9841
被引量1
参考文献量2
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