当代医学2022,Vol.28Issue(11) :1-4.DOI:10.3969/j.issn.1009-4393.2022.11.001

大规模分析揭示胶质母细胞瘤致病关键基因及SYN1生存预后因子

Large-scale analysis revealing key genes of glioblastoma tumorigenesis and SYN1 as survival prognostic factor

耿艳敏 李超 谭军
当代医学2022,Vol.28Issue(11) :1-4.DOI:10.3969/j.issn.1009-4393.2022.11.001

大规模分析揭示胶质母细胞瘤致病关键基因及SYN1生存预后因子

Large-scale analysis revealing key genes of glioblastoma tumorigenesis and SYN1 as survival prognostic factor

耿艳敏 1李超 2谭军1
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作者信息

  • 1. 新乡医学院第三临床学院,河南 新乡 453003
  • 2. 佛山市妇幼保健院,广东 佛山 528000
  • 折叠

摘要

目的 分析揭示胶质母细胞瘤(GBM)致病关键基因及SYN1生存预后因子.方法 从TCGA数据库下载最新的GBM基因表达谱数据和临床资料并整理,借助R语言挖掘差异基因,采用String数据库和Cytoscape软件鉴定网络核心基因,运用Kaplan-Meier法绘制核心基因生存曲线,初步筛选预后相关基因.结果 本研究中共筛选出下调差异基因868个,上调差异基因458个,分子互作网络鉴定出前10个关键候选核心基因,生存曲线分析发现仅SYN1与GBM患者预后相关,高表达组预测GBM患者生存时间更短.结论 本研究采用的方法学和初步筛选的相关关键基因有助于了解GBM的发生发展机制,推测SYN1为可能的预后因子,但其对GBM患者生存时间的具体影响机制和预后效能还需更深入的研究.

关键词

胶质母细胞瘤/SYN1/生物信息学/TCGA数据库/预后因子/生存曲线

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出版年

2022
当代医学
中国医疗保健国际交流促进会

当代医学

影响因子:1.122
ISSN:1009-4393
浏览量1
参考文献量17
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