基于线粒体COI基因探讨鹟亚科部分属和种的分类地位
Phylogeny of Some Muscicapinae Genera and Species Inferred from Mitochondrial Gene COI Sequences
雷忻 1廉振民 2雷富民 3尹祚华 3赵洪峰4
作者信息
- 1. 中国科学院动物研究所,北京,100080;陕西师范大学,生命科学学院,西安,710062;延安大学,生命科学学院,延安,716000
- 2. 陕西师范大学,生命科学学院,西安,710062;延安大学,生命科学学院,延安,716000
- 3. 中国科学院动物研究所,北京,100080
- 4. 中国科学院动物研究所,北京,100080;陕西师范大学,生命科学学院,西安,710062
- 折叠
摘要
采用PCR扩增、测序的方法,对鹟亚科(Muscicapinae)6属16种鸟类的线粒体COI基因序列1 176 bp进行测定,并以荒漠伯劳和发冠卷尾作为外群构建Bayes、ML、MP 3棵系统发育树.结果支持:寿带属(Terpsiphone)、扇尾鹟属(Rhipidura)、方尾鹟属(Culicicapa)3属与鹟亚科其他鸟类亲缘关系较远,扇尾鹟属与方尾鹟属亲缘关系较近;鹟属(Muscicapa)为单系发生,本研究结果未能确定它与仙鹟属、姬鹟属的进化关系;铜蓝鹟(Muscicapa thalassina)从鹟属中移出,归入仙鹟属.上述结论解决了鹟亚科部分属间的进化关系,为鹟亚科分类系统的研究提供了分子水平证据.
Abstract
This paper investigates phylogenetic relationships within the Muscicapinae based on analysis of cytochrome oxidase I mitochondrial gene sequences (1 176 bp). Sixteen species representing six of eight putative Muscicapinae genera were analysed, and Dicrurus hottentottus and Lanius isabellinus were selected as outgroups. Phylogenetic trees were reconstructed using the Bayesian ( BI) , maximum-likelihood ( ML) and maximum parsimony ( MP) methods. The results suggest that Terpsiphone, Rhipidura and Culicicapa are distant relatives of the other genera of Muscicapinae, and Rhipidura is a close relative of Culicicapa. Muscicapa is a monophyletic taxon, but the phylogenetic relationships of Muscicapa, Niltava and Ficedula are still uncertain. Our results suggest that Muscicapa thalassina should be placed in Niltava. These results resolve the phylogenetic relationships among some genera of Muscicapinae and provide some molecular phylogenetic evidence for taxonomic research of Muscicapinae.
关键词
鹟亚科/COI基因/DNA序列/系统发生Key words
Muscicapinae/COI gene/DNA sequence/Phylogeny引用本文复制引用
基金项目
国家自然科学基金(30270182)
国家自然科学基金(30270203)
国家自然科学基金(30611140611)
中国科学院-斯洛伐克科学院合作协议项目()
中国科学院动物所创新项目(KSCX3-IOZ-0614)
陕西省教育厅资助项目(05JK314)
出版年
2007
国家科技期刊平台
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