肠道微生物能够调节动物机体的物质与能量代谢,参与免疫和疾病预防,对于维持动物的正常生理活动至关重要.本研究基于16S rRNA高通量测序,对患肠炎病和健康群组鸳鸯(Aix galericulata)的肠道微生物进行对比,尝试揭示鸳鸯肠炎可能的致病菌.鸳鸯肠道微生物共鉴定出2020个相似度97%的操作分类单元(OTU).健康组和肠炎组共同的OTU数量为564个.健康组鸳鸯的微生物Alpha多样性指数与肠炎组之间无显著差异(Mann Whitney U test,P>0.05).在门水平,鸳鸯的肠道微生物组成以厚壁菌门(Firmicutes)(73.46%)、拟杆菌门(Bacteroidetes) (11.15%)和变形菌门(Proteobacteria)(8.72%)为主.在属水平,丰度最高的类别主要包括狭义梭菌属(Clostridium sensu strict01)(29.65%)、库特氏菌属(Kurthia) (24.74%)和乳杆菌属(Lactobacillus)(12.40%).健康组和肠炎组鸳鸯肠道微生物组成存在显著差异(Adonis,F=3.6087,P<0.05).在肠炎组中共筛选出25个相对丰度显著高于健康组的类别,其中,狭义梭菌属、埃希氏志贺菌属(Escherichia-Shigella)和脱硫菌属(Desulfovibrio)的相对丰度最高(线性判别分析LDA值>5,P<0.05),这3个属的致病菌可能造成肠道微生物群落失衡,机体免疫力下降,是诱发鸳鸯肠炎的重要因素.
Gut Microbiota and Their Possible Correlation to Enteritis in Captive Aix galericulata