首页|甘蔗栽培种WRKY基因家族鉴定及其在黑穗病菌胁迫下的表达分析

甘蔗栽培种WRKY基因家族鉴定及其在黑穗病菌胁迫下的表达分析

扫码查看
原文链接
  • 国家科技期刊平台
  • NETL
  • NSTL
  • 万方数据
  • 维普
从甘蔗栽培种R570基因组数据库中挖掘到60个ShWRKY(ShWRKY1～ShWRKY600)基因,分布于10条染色体上,每条染色体上有3～13个ShWRKY基因.系统进化树分析表明60个ShWRKY蛋白中,属于Ⅰ、Ⅱ和Ⅲ类的分别有10、32和18个.所有ShWRKY家族成员皆为亲水性核定位蛋白,且除ShWRKY13为稳定蛋白外,其余家族成员都不稳定.ShWRKY基因家族的外显子数目为1～5个,保守基序数目为3～7个.启动子区域序列预测显示,ShWRKY基因包含多个与胁迫、生长发育和激素响应相关的顺式作用元件.表达谱分析显示,ShWRKY基因在甘蔗不同组织中差异表达,且参与对黑穗病菌胁迫的响应过程.RT-qPCR检测结果显示,接种黑穗病菌7 d后,ShWRKY37基因在2个甘蔗抗病品种和1个感病品种中上调表达,而在另外1个感病品种中下调表达;ShWRKY51基因则在抗病品种中下调表达,而在感病品种应答早期(1 d)上调表达.
Identification of WRKY gene family in sugarcane cultivar and expression analysis under Sporisorium scitamineum stress

王东姣、张畅、阙蓓蓓、尤垂淮、罗俊、苏亚春

展开 >

福建农林大学农业农村部福建甘蔗生物学与遗传育种重点实验室

福建农林大学教育部作物遗传育种与综合利用重点实验室

福建农林大学国际学院

福建农林大学生命科学学院,福建 福州350002

展开 >

甘蔗 WRKY转录因子 生物信息学分析 黑穗病菌胁迫 基因表达

福建农林大学科技创新专项基金福建省自然科学基金财政部和农业农村部国家现代农业产业技术体系项目

CXZX2020081A2020J01591CARS-17

2022

10.13323/j.cnki.j.fafu(nat.sci.).2022.01.001

福建农林大学学报(自然科学版)
福建农林大学

福建农林大学学报(自然科学版)

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子：0.582
ISSN：1671-5470
年,卷(期)：2022.51(1)
  • 3
  • 7