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蓝尾蝾螈皮肤转录组及活性多肽分析

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通过对蓝尾蝾螈皮肤进行转录组测序,首次报道了蓝尾蝾螈皮肤的转录组及其活性多肽成分.采用Illumina Hiseq4000共测定了6.65 Gb数据;组装和去冗余后共获得75462个unigene,其N50、GC含量、平均长度、总长度分别为1617 bp、45.64%、818 bp、61801999 bp.通过基因注释,共获得34850个非冗余注释unigene(占unigene总数的46.18%),注释结果为两栖类物种的unigene数目约占注释总数的16%.根据unigene的COG和GO注释结果,统计了各自的功能分类.其中,对鉴定到的多种活性多肽进行了初步的生物信息学分析,为诠释蓝尾蝾螈皮肤生理学功能提供依据.
Analysis of transcriptome and active peptides from Cynops cyanurus skin

唐兴、王洪亮、梁广男、刘雅莉、段志贵

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衡阳师范学院生命科学与环境学院,湖南 衡阳421008

衡阳师范学院南岳山区生物资源保护与利用湖南省重点实验室,湖南 衡阳421008

东华理工大学江西省质谱科学与仪器重点实验室,江西南昌330013

湖南师范大学动物多肽药物国家地方联合工程实验室,湖南长沙410081

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蓝尾蝾螈 转录组测序 活性多肽 基因注释 生理学功能

国家自然科学基金国家自然科学基金长江学者和创新团队发展计划湖南省生物发育工程及新产品研发协同中心项目衡阳师范学院科学基金科研项目南岳山区生物资源保护与利用湖南省重点实验室开放基金湖南省教育厅科学研究项目

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2022

福建农林大学学报(自然科学版)
福建农林大学

福建农林大学学报(自然科学版)

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子:0.582
ISSN:1671-5470
年,卷(期):2022.51(1)
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