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香樟及近缘种的亲缘关系分析

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基于全基因组重测序技术开发的SNP标记,对香樟及近缘种的亲缘关系进行分析,结果表明,通过对16个香樟无性系和2个近缘种进行重测序分析,共获得209 Gb原始数据,平均有效测序深度16×.共获得约209308831个高质量SNP,纯合SNP共165814908个,杂合SNP共43493923个.由系统进化树可知11份芳樟无性系聚在一起,3份芳樟无性系与油樟聚在一起,然后与龙脑樟聚在一起,沉水樟和肉桂先被分离出来;通过主成分分析将16份香樟无性系分为3类,分别为芳樟类群、龙脑樟和油樟类群;芳樟、龙脑樟和油樟精油成分存在差异,为不同的化学利用类型.
Genetic relationship analysis of Cinnamomum camphora and its related species

向双、孙维红、万晓会、丁乐、韩国勇、邹双全、邹小兴

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福建农林大学林学院,福建 福州350002

福建省林业调查规划院,福建 福州350001

福州植物园,福建 福州350000

香樟 SNP标记 亲缘关系

省级财政林业专项福建农林大学优硕基金福建省林业厅推广基金

2021FKJ19118/1122YS010082021TG10

2022

10.13323/j.cnki.j.fafu(nat.sci.).2022.02.008

福建农林大学学报(自然科学版)
福建农林大学

福建农林大学学报(自然科学版)

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子：0.582
ISSN：1671-5470
年,卷(期)：2022.51(2)
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