为研究微管蛋白(tubulin)家族成员在龙眼体胚发生早期的表达模式,基于龙眼基因组数据库,采用生物信息学方法对龙眼tubulin家族蛋白理化性质、系统进化关系、基因扩张、进化选择模式、染色体分布、基因结构、蛋白保守基序和启动子顺式作用元件进行分析.基于龙眼体胚发生早期转录组数据库,分析tubulin家族成员在体胚发生早期的表达模式,并采用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)技术进行验证.结果表明:龙眼tubulin家族共有15个成员,其中,α-tubulin类型成员6个,β-tubulin类型成员8个,γ-tubulin类型成员1个(TUBG2),所有成员均包含tubulin和tubulin C两个保守结构域.同一类型tubulin家族成员间的亲缘关系较近,不同类型间的亲缘关系较远.龙眼tubulin家族15个成员分布在10条染色体上,氨基酸数目为197～473个,分子质量为21.88～53.25 ku,等电点为4.44～5.67,为酸性蛋白.龙眼tubulin家族基因外显子数目为3～11个,其编码的蛋白具有高度保守的基序.龙眼tubulin家族基因启动子区域存在光、激素、细胞周期、分生组织和抗逆境胁迫等响应元件.对tubulin家族基因在龙眼体胚发生早期的表达模式进行分析发现,龙眼tubulin家族大多数成员在体胚发生早期呈下调表达趋势,在胚性愈伤组织阶段的表达量高于球形胚阶段.以上结果表明,龙眼tubulin家族成员高度保守,且在胚性愈伤组织中大量累积,可能在龙眼胚性愈伤组织的胚性维持中发挥重要作用.
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