首页|橄榄叶绿体基因组密码子偏好性特征

橄榄叶绿体基因组密码子偏好性特征

扫码查看
原文链接
  • 万方数据
  • 维普
利用CodonW程序和EMBOSS在线软件对橄榄叶绿体基因组进行密码子偏好性分析,并研究其密码子偏好性形成的影响因素.结果表明,橄榄叶绿体基因组有效密码子数(ENc)、密码子GC含量(GC)和密码子第3位上的GC含量(GC3s)分别为50.36、0.385和0.305,CGT、CCT和GGT等可作为橄榄叶绿体基因的最优密码子.中性绘图分析、ENc对应分析、偏倚分析和同义密码子相对使用度对应性分析发现,橄榄叶绿体基因组密码子偏好性不是单一因素影响的结果.橄榄叶绿体基因组密码子偏好性较弱,整体上偏好使用A和T,这种偏好性可能受突变压力、自然选择和其他因素的共同作用.
Codon usage preference of chloroplast genome of Canarium album

赖瑞联、陈瑾、冯新、覃振师、陈义挺、沈朝贵、田奇琳、吴如健

展开 >

福建省农业科学院果树研究所,福建 福州350013

广西农业科学院广西南亚热带农业科学研究所,广西 崇左532415

闽南师范大学生物科学与技术学院,福建 漳州363000

橄榄 叶绿体 基因组 密码子偏好性 进化

农业部物种品种资源保护(热带作物)项目福建省自然科学基金福建省人民政府与中国农科院农业高质量发展超越"5511"协同创新工程项目漳州市自然科学基金

1518213013540517012019J01110XTCXGC2021019ZZ2020J35

2022

10.13323/j.cnki.j.fafu(nat.sci.).2022.04.008

福建农林大学学报(自然科学版)
福建农林大学

福建农林大学学报(自然科学版)

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子：0.582
ISSN：1671-5470
年,卷(期)：2022.51(4)
  • 7
  • 14