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月季、蔷薇和玫瑰叶绿体基因组的比较

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月季、蔷薇和玫瑰是隶属于蔷薇科蔷薇属的姊妹树种,由于长时间的杂交和人工栽培,三者的形态很难区分,急需开发一套分子标记对三者进行鉴定.据此,本研究获取了月季、蔷薇和玫瑰的叶绿体基因组序列,对其基因组序列的特点、简单重复序列(SSR)分子标记、核苷酸多态性及月季、蔷薇和玫瑰在蔷薇属内的系统发育关系进行了分析.结果表明:月季、蔷薇和玫瑰的叶绿体基因组全长分别为 156 591、156 592、157 110 bp,均具有非常典型的四分体结构;月季、蔷薇和玫瑰叶绿体基因组分别含有 131、137、136 个基因,总GC含量均为 37.00%;月季、蔷薇和玫瑰叶绿体基因组的结构高度相似,共线性关系良好,蛋白编码区域保守度与相似度最高;在月季、蔷薇和玫瑰的叶绿体基因组中分别鉴定出 57、59、46 个SSR,且绝大多数是单核苷酸重复序列;以筛选到的matK基因作为分子标记构建的系统发育树显示,蔷薇科蔷薇属植物聚为一个单系类群,可以区分月季、蔷薇和玫瑰,且月季与蔷薇的亲缘关系最近.本研究结果可为后续蔷薇属植物的遗传多样性、遗传结构及系统发育研究提供参考.
Comparison of chloroplast genomes of Rosa chinensis,Rosa multiflora and Rosa rugosa

Rosa chinensisRosa multifloraRosa rugosachloroplast genome

侯哲、李昂、黄长兵

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苏州农业职业技术学院园林工程学院,江苏 苏州 215008

月季 蔷薇 玫瑰 叶绿体基因组

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JBGS[2021]091SNG2022025LYKJ[2021]02苏[2022]TG10BS[2022]082022NSFSC1141LYKJ[2022]10

2023

福建农林大学学报(自然科学版)
福建农林大学

福建农林大学学报(自然科学版)

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子:0.582
ISSN:1671-5470
年,卷(期):2023.52(6)
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