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油茶闽43叶绿体基因组序列特征及其近缘物种亲缘关系分析

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为了探究油茶闽43与山茶属近缘物种间叶绿体基因组的差异以及进化关系,利用基因组学分析方法,对油茶闽43与其他近缘山茶属物种叶绿体基因组进行比较分析.叶绿体基因组结构特征分析结果显示:9种山茶属物种的叶绿体基因组大小为156 902～157 567 bp,有130～136个基因.REPuter分析发现,这9种山茶属物种的长重复序列类型均为P和F,通过MISA软件确定9种山茶属物种的SSR数量为52～71个,其中闽43的SSR数量为65个.通过IR边界分析,白毛茶和油茶闽43与其他3种属内物种的边界基因有较为明显差异,同时通过核苷酸多态性分析,检测出叶绿体基因组共有5个高变区,分别为psbK～atpA、rpoB～psbD、rps4～ndhJ、ycf1、ndhF～rps12～exon1.并从系统发育树的结果得出,油茶闽43与落瓣油茶的亲缘关系最近.该研究可为普通油茶种群遗传结构提供基础,为提高普通油茶的产油量以及优良品种的选育提供理论依据.
Analysis of the Sequence Characteristics of Chloroplast Genome and the Genetic Relationship of Closely Related Species of Camellia oleifera Min 43

王小薇、陈世品

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福建农林大学林学院,福建 福州 350002

油茶 叶绿体基因组 长重复序列 系统发育树

福建省种业创新与产业化工程项目

ZYCX-LY202103

2023

10.13651/j.cnki.fjnykj.2023.01.002

福建农业科技
福建省农业科学院 福建省农学会

福建农业科技

影响因子：0.254
ISSN：0253-2301
年,卷(期)：2023.54(1)
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