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甘蔗印度种响应干旱胁迫的数字基因表达谱

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本研究以甘蔗印度种的代表品种“春尼”为试材,采用数字基因表达谱(DGE)技术对干旱胁迫后的“春尼”进行差异基因表达分析,共筛选到差异表达基因9 810个,其中上调表达4 687个,下调表达5 123个.GO功能显著性富集分析表明:差异表达基因主要定位于细胞质、质体、叶绿体、类囊体等,主要行使催化活性、氧化还原酶活性、辅因子结合、裂解酶活性等功能,主要涉及小分子代谢、细胞酮体代谢、有机酸代谢、含氧酸代谢、化学刺激应答、非生物刺激应答等生物过程.KEGG显著性富集分析表明:差异表达基因主要涉及植物激素信号转导、RNA转运、次生代谢产物的生物合成、淀粉和蔗糖代谢、泛素化蛋白降解、嘌呤碱代谢等通路.利用实时荧光定量PCR (qRT-PCR)分析2个差异表达上调基因在“春尼”的苗期、伸长期、成熟期受干旱诱导的表达情况,结果均为“上调-上调-上调”模式,验证了DGE测序结果可靠、重复性好.
Digital Gene Expression Profiling of S.barberi J.Response to Drought Stress

李穆、程志远、何丽莲、王先宏、李富生

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云南农业大学农学与生物技术学院,昆明,650201

广西壮族自治区亚热带作物研究所,南宁,530001

中国农业科学院作物科学研究所,北京,100081

甘蔗印度种 春尼 干旱 数字基因表达谱 差异表达基因

国家自然科学基金云南省应用基础研究重点项目云南省现代农业甘蔗产业技术体系建设专项

315604172015FA0242009-2017

2018

10.13271/j.mpb.016.002099

分子植物育种
海南省生物工程协会

分子植物育种

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子：0.765
ISSN：1672-416X
年,卷(期)：2018.16(7)
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